五胡亂華時，盡管世家門閥在南北動蕩中受到沖擊，但其實并未遭受太大損害。自漢末以來，世家一直擁有塢堡、土地、農民依附、書籍和聲望。胡人更多地破壞了平民或者豪強的產業(yè)，反而是流民被世家吸納，使世家更加強大，形成了五姓七望這樣的龐然大物。北方外族入侵只是讓世家服軟了一段時間。即便是黃巢，他的起義雖然有推翻世家的目標，但實際上門閥士族在安史之亂時期已經基本終結，貞觀至開元盛世是世家敗落的時期，尤其在武則天時期，世家被徹底削弱。
黃巢并非寒門出身，他是個走私生意的富翁。他之所以未能通過科舉考試，顯然是因為個人水平不佳，甚至沒有參與潛規(guī)則的資格。黃巢的造反原因并非科舉落榜，而是他從事私鹽貿易，這一行為違法，朝廷自然要對其進行打擊，這才是他造反的起因。黃巢沒有固定的根據(jù)地，只能隨處搶劫。至于他喊出的“均田地”口號，實際上無法實現(xiàn)。
黃巢甚至接受了唐朝的招安，說明他不僅不是農民起義的領袖，連農民身份都稱不上。他不能代表農民階層，因為他本身是土匪階層的一員，是整個社會的敗類。他的起義并非出于追求均富，均田地，更不是為了百姓福祉，而純粹是為了自己。
盡管黃巢消滅了門閥士族，但卻讓整個中國社會的組織度更加碎片化。門閥士族雖然存在自私腐朽的問題，但出于自身利益考慮，客觀上在一定程度上約束了君權的過度擴張。然而，門閥的滅亡導致了宋朝以后君權的全面強化。
世家門閥雖然腐朽，但在國家昌盛時期，卻有一些自覺和主動的“股東”、“合伙人”精神。而文人士大夫階層則僅僅是“滿口仁義道德”，因為他們并非國家的“股東”，只是打工的身份。在門閥倒臺后，代替者比他們更為腐化。宋明兩朝的貪污情況表明，門閥士族的衰落并非帶來更好的替代者。
世家門閥的真正衰落原因在于產生他們的歷史條件已逐漸消失。山東世族和江南世族從隋唐統(tǒng)一開始受到打壓，逐漸衰退。而地方豪強大族的屬性也在隋唐時逐漸喪失，越來越向文化世家和宮廷世家轉變，失去了在鄉(xiāng)土中盤踞的實力。黃巢的登場，則使關隴軍事集團遭受重創(chuàng)。到了宋之后，皇權加強、文化教育向普通士人拓展，以及科舉制度的改革，導致門閥世族與皇帝共治的時代逐漸結束。
